仙剑电影本剧改编自清水玲子所著同名漫画，以科学警察研究所的法医第九研究室，通称“第九”为舞台，利用特殊的MRI技术再现死者的生前记忆。拥有罕见容貌、惊人记忆力和敏锐洞察力的薪刚（板垣李光人 饰），是第九的创始成员兼室长。由于某个事件，既是好友又是同事的铃木克洋（中岛裕翔 饰）去世了，在薪的面前，被分配到了一模一样的新人搜查员青木一行（中岛裕翔 饰）。两人看到了死者直到临终都隐藏着的“想法”和“秘密”，虽然心中抱有罪恶感和纠葛，但仍为解决难案而奋斗，成为无可替代的搭档。